庞师古的许多部队此时还未接到作战命令，仓促上阵，十分狼狈。清口大营一时间喊杀声惊天动地。看到前军和奇兵都已得手，杨行密亲自率领大军渡过淮河，同朱瑾他们一起夹攻庞师古大军。庞师古军完全陷于困境，部队指挥混乱，斗志全无。宣武军大败，主将庞师古阵亡，主将以下被斩将士超过万人。余众除了被俘的外，都溃归葛从周军。
庞师古军被击溃，葛从周军日子也不好过。他原来的任务是夺取寿州。但他的兵力太少，对手朱延寿又很强，不足以完成任务，所以直到庞师古军覆没以前，他都没有获得进展。他本在寿州的西北安营扎寨，结果反被朱延寿打破了大营。立脚不住的葛从周被迫转移到濠州，企图和庞师古军靠拢。
当葛从周接到庞师古军大败的报告后，立刻意识到大势已去。原来企图和主力靠拢作战的计划，却因为主力的覆没，反使自己落入了敌人的袋型阵地中，如果不赶快从濠州脱身，那么庞师古的下场就是自己的榜样。葛从周放弃了所有的辎重和其他累赘的东西，向北狂奔。
杨行密、朱瑾在战胜庞师古军后，稍事休整，尾追而来。他们和朱延寿会师后，马不停蹄地追赶，终于在淠水赶上葛从周。葛从周对此无可奈何，他不能在此久留，部队士气极度低落，又没有辎重补给，想在此顽抗等待援军是不可能的。
葛从周咬紧牙关，强行渡淮。结果军才半渡，就被朱瑾的骑兵所乘，全军几乎被杀得殆尽，光在淮河上就浮尸万余具。幸亏遏后都指挥使牛存节激励将士，弃马步斗，这才稍稍挡住淮南军的进攻。葛从周和残部赖此勉强逃脱。
渡淮之后，葛从周军又冻又饿。撤退过程中，连续四天没有食物，又恰逢天下大雪，士兵的忍受能力到了极限，沿途因饥寒倒毙的比比皆是。直到到了颍州境内，刺史王敬尧在他所辖境内的路上烧炭为士兵取暖，提供补给，这才让残军数千人逃回。
朱温本人在得知前线两路大军的惨败消息后，吓得胆战心惊，只得赶快从宿州撤退。宣武军来时是如此的气势汹汹，逃时却是如此狼狈，为此杨行密调侃朱温，写信说道：" 庞师古、葛从周，非我敌手，公宜来淮上决战。"几天后在寿州又发生了一次战斗，七天后也以朱温军的失败告终，至此，清口之战以朱温惨败收场。
杨行密取胜之后，大会诸将，极称李承嗣有谋，表领镇海节度使，且待史俨也甚厚。还军后各赐第宅及姬妾。两人于是愿意为杨行密效力，后来屡次立功。李克用也遣人贻书，求杨行密归还史、李二人。杨行密留住不放，但复书修好，只说待缓日遣归，由是得保据江淮，朱温从再也不敢与杨行密争夺淮南。
再说梧州司马崔昭纬，沿途逗留，不肯往就贬所。推说道梗难通，一面发书朱温，求他挽回，朱温置诸不理。唐廷已有所闻，遣中使追到荆南，勒令自尽。李茂贞、韩建两人，素来与崔昭纬表里为奸，不忍闻他诛死，因而又想伺隙发难。可巧昭宗置殿后四军，选補数万人，使延王李戒丕等统带，借以护卫自己。
李茂贞乘间上表，诡说延王将称兵讨臣，臣今勒兵入朝请罪。昭宗览表大惊，连忙向河东告急。偏偏远水难救近火，河东尚未接洽，凤翔大军已逼近京畿。覃王李嗣周带着卫军，出兵阻拦李茂贞，李茂贞不待晤谈，便指挥众士，杀退李嗣周，直达长安城下。
延王李戒丕，入告昭宗，说道：“关中藩镇，无可依托，不如由鄜州渡河，前往太原。”昭宗因而草草整装，挈着嫔妃嗣王等数十人，潜出都城，奔至渭北。韩建遣子韩从允奉表，请昭宗移驾华州，昭宗知道韩建不怀好意，不肯听从。但是任命韩建为京畿都指挥，兼安抚制置，及催促诸道纲运等使，自启驾至富平。韩建又奉表固请，从官亦不愿意远去，于是召韩建到行营，面议去留。
韩建抵达富平，谒见昭宗，顿首泣陈道：“方今藩镇跋扈，不止李茂贞一人，陛下若离去，宗庙园陵，何人居守？臣恐车驾渡河，再无归期。今华州兵力虽微，控带关辅，尚可自守。臣积聚训厉，已十三年，西距长安不远，愿陛下惠临，徐图兴复，臣愿为陛下尽力。”
昭宗因而跟着韩建来到华州，就府署为行宫。韩建请罢免崔胤相职，改授尚书左丞陆扆为同平章事，王搏也相继被免相，用左谏议大夫朱朴代任。崔胤密求朱温，替他转圜，又教他营修东都宫阙，上表请迎皇帝车驾。朱温依言上表，力言崔胤是忠臣，不应免职，自愿率兵迎跸。
韩建不免惊慌，于是又召回崔胤为相。遣人谕止朱温。
崔胤再黜再进，排挤陆扆，诬他党同李茂贞。陆扆遭贬为硖州刺史。李茂贞入长安，又放了一把无名火，将重修的宫室市肆，焚毁俱尽。昭宗闻报，命宰相孙偓，为凤翔四面行营招讨使，讨李茂贞。
李茂贞这才上表请罪，献上助修宫室之钱。韩建暗中袒护李茂贞，阻止孙偓出师。奏称睦、济、韶、通、彭、韩、仪、陈八王，均系唐朝宗室，谋劫车驾前往河中。昭宗似信非信，召韩建入问。韩建又托疾不入。昭宗不得已，令八王自己去见韩建自陈。
韩建拒绝不见，但再表申请勒令诸王回府，妙选师傅，教以诗书，不准统兵参政。昭宗此刻已经陷入虎口，无法推诿，只得诏令诸王所领军士，遣归田里。韩建又请撤去殿后四军，昭宗不敢不从。天子亲军，至此尽撤。捧日都头李筠，为石门扈从第一功臣，韩建诬告他谋反，请旨处斩。
李筠冤死，韩建还不满足，索性大起杀心，纵兵围住诸王第，拿住覃王李嗣周，延王李戒丕，通王李滋，沂王李禋，彭王李惕，丹王李允，及韶王、陈、韩、济、睦等十一王，共牵至石堤谷，冤诬反状。
可怜诸王被发徒跣，极口呼冤，随他叫破喉咙，没一个出来救护，号炮一鸣，刀光四闪，十一王首级，都落到地下。韩建先斩后奏，以谋反罪上告昭宗。韩建又强慰昭宗，请立德王李裕为皇太子，李裕是昭宗儿子，淑妃何氏所生。何氏方从幸华州，韩建向何氏讨好，立李裕为储君，并请册何氏为皇后。
孙偓受诏不行，撤去招讨使，并罢相位。朱朴也被免职，王搏再相，也无术维持国政。李茂贞官爵，忽夺忽还，毫无定策。东川为王建所并，节度使颜彦晖自杀。威武节度使王潮逝世，弟审知知军府事，魏博节度使罗弘信死了，其子罗绍威自称留后。当时虽上表奏报，昭宗还有甚么辩论，不过是有求必应，滥给诏书，予他旌节，便算了事。
回鹘别部庞特勒后裔，以及南诏嗣酋舜化，先后上书，唐廷也无暇回答。幸好外夷也多衰微，无心入寇，所以边疆尚安，只是内乱难平。李克用听说李茂贞再次犯阙，想发兵进援。李茂贞素来忌惮李克用，因而诈称改过，上表谢罪。
后来又得知朱温营洛阳宫，有迎驾之意，连忙驰表行宫，表示愿意修复宫阙，奉昭宗回归长安。韩建已与李茂贞串同一气，也劝昭宗还都，昭宗乃令韩建为修宫阙使。韩建与李茂贞共同致书河东，愿与李克用修和。李克用此时正攻打幽州，乐得应允，韩建即奉驾还都。
幽州节度使刘仁恭，本是李克用所保荐。刘仁恭到镇之后，李克用派亲兵千人监督着刘仁恭。所有租赋，除供给军需外，都令输送到晋阳。昭宗出奔华州，李克用便向刘仁恭征兵，一同入援。刘仁恭不肯答应，李克用发书责备。刘仁恭反掷书辱骂，并拘住使者。
李克用大怒，亲自率兵往攻幽州。李克用中途饮酒，被刘仁恭部将单可及，设伏杀败，奔还晋阳。刘仁恭恐李克用复仇，即与朱温联络。朱温会同幽州、魏博两镇军士，攻拔邢、洺、磁三州。昭宗还京大赦，下诏罪己，改元光化。一面命太子宾客张有孚，为河东汴州宣慰使，替双方和解。李克用倒想奉诏停战，但是朱温却不肯答应。泽州守将李罕之，本来依附李克用，平定王行瑜。李罕之本思代镇邠宁，李克用却说不应该恃功要挟，李罕之只得怏怏回到泽州。
刚好会昭义节度使薛志勤病故，李罕之即自泽州进入潞州，掌握了昭义军。李克用得知后，遣使责备。李罕之恐惧，急忙归附了朱温，请他援助。朱温自是大喜，上表荐李罕之为昭义节度使。李克用忿怒，遣李嗣昭袭取泽州，掳得李罕之家属，囚送晋阳。李罕之惊惶成疾，竟致不起。
朱温急使部将贺德伦代守潞州，李嗣昭移军围攻，贺德伦不敌逃走。泽、潞两州再归李克用，李克用授孟迁为留后。刘仁恭与魏州失和，大举进攻贝州，魏博节度使罗绍威，向汴梁求救。朱温派遣部将李思安等，率兵救援魏博，大破幽州兵，斩了刘仁恭骁将单可及。可及是刘仁恭妹婿，骁勇绝伦，绰号单无敌，因中了李思安之计，中伏败死，幽州夺气。
刘仁恭亲自督兵拒战，又被汴将葛从周杀退，损失惨重，仅与儿子刘守文狼狈逃回。葛从周乘胜攻打河东，拔取承天军，部将氏叔琮拔辽州。李克用遣将周德威大破叔琮，生擒叔琮骁将陈夜叉，叔琮逃去，葛从周也率军退回。
不久保义军兵变，杀死节度使王珙，推都将李璠为留后。李璠又被朱简所杀，简与朱温同姓，因而作书相遗，改名友谦，愿为朱温子侄。朱温笑允来使，自是陕、虢一带，也成了朱温的地盘。
朱温又北攻镇州，成德节度使王熔求和，献子为质。义武节度使王郜，驻守定州，也被朱温部将张存敬所攻，出战大败，奔赴晋阳。兵马使王处直，投降了朱温，用缯帛十万犒师。朱温这才回军，仍为王处直表求节钺。河北诸镇，又归附到朱温帐下。朱温势力，占有中原大半，各方镇无与伦比。
乾宁三年(896年)五月，荆南节度使成汭图谋西进。成汭，淮西人。年少时是一个无赖，曾因醉酒杀人，逃亡寺庙躲避。黄巢造反时，成汭也乘机作乱，加入秦宗权的蔡州军，被一郭姓将领收为养子，改名为郭禹。但郭禹的野心和欲望极大，不甘寄人篱下，当秦宗权任命郭禹驻守江陵时，郭禹便再次率部脱离秦宗权，占据火门山，当起了打劫劫舍的强盗。
此时的荆南节度使陈儒却很欣赏郭禹。郭禹趁机接受招安，投靠陈儒，成了荆南的裨将。不久，淮南节度使高骈手下大将张瑰、韩师德因受吕用之排挤，投靠荆南。陈儒命他们攻击朗州刺史雷满，谁知张瑰反而回兵把陈儒杀了，自称节度使。张瑰对郭禹的勇武颇为忌惮，郭禹于是率千余人南奔归州，据城自称刺史，招徕流亡，勤加训练，拥有精兵三千人。
881年，秦宗权垂涎荆南富庶，遣其弟秦宗言来攻，张瑰固守城池二年，城中死者相继，以至人相食。但秦宗言终不能攻克，只得退兵。886年，秦宗权又命山南东道留后赵德諲包围江陵，张瑰无奈之下，向郭禹求救。郭禹与峡州刺史潘章联兵来援，赵德諲退走。
887年，赵德諲再次围攻江陵，城中力疲，复州长史陈璠斩了张瑰出降。赵德諲破城后，尽掠城中财物，留下大将王建肇守城。此时，郭禹从归州出兵，先袭破清江，擒守将牟权，再攻江陵，击败了王建肇，后者逃往黔州。唐昭宗于是任命郭禹为荆南留后。
郭禹自此恢复姓名为成汭，当时荆南屡遭兵灾，人口只剩下十七户。成汭励精图治，以贤士贺隐为智囊，言听计从，勤政爱民，招集流亡人士，减免赋税，通商务农，只数年人口即恢复为数万户。成汭执掌荆南大权，虽有政绩，但也有内患。
夔州刺史韩楚言不服成汭，西川节度使王建派兵占领忠州，秦宗权派大将常厚屯白帝城，准备联合攻打成汭。 危急之际，成汭命大将许存偷袭白帝城，大破常厚，一举攻占夔州，韩楚言自杀。
896年，成汭率领大将赵武、许存等人溯江而上，向退守黔州、自称武泰节度使的王建肇展开攻击，一举攻克。王建肇收余众退保丰都，许存乘胜攻取渝、涪二州。成汭对许存非常忌惮，于是任命大将赵武为武泰留后，令许存为万州刺史。许存不服，怠于政务，成天以踢球为乐。
成汭却认为他要叛变，派兵攻击，许存投奔王建。赵武不断进攻丰都，王建肇坚持不住，也归附了王建。不久，朝廷正式任命成汭为荆南节度使，后又累进为检校太尉，中书令、上谷郡王。成汭的荆南节度使的地域十分富庶，占据长江中游，包括江陵、归、陕、夔、万、忠等五州一府。
马殷得知成汭势力大增之后，心中难免有些恐惧。毕竟荆南距离潭州实在太近，而自己目前仅仅有潭州一地，邵州战事还没有结束。如果此时有外敌入侵，自己未必能挡得住。马殷急忙召集众人，说道：“最近杨行密和成汭的实力雄厚，本帅打算多送些金银财帛给他们，和他们搞好关系，为我们争取到和平的环境。诸位意下如何？”
高郁当即反对，说道：“成汭的地盘并不算大，军力也不算强。他也不是成大事之人，不足为虑，他威胁不了我们。至于杨行密，我们和他在淮南恶战多年，早已结下血海深仇，即使你贿赂他万两黄金，他也不可能同你言归于好。我们是要送礼，但对象不应是杨行密和成汭，而应该是大唐朝廷。我们应该对上尊奉天子，对下安抚军民，同时励兵秣马、整装待戈，等待时机，如此则霸业可成，谁还能威胁得了我们？”
马殷仔细一想，顿时豁然开朗，大感有理，立即照办。从此之后，“上奉天子，下安士民。”就成了马殷的基本策略。不管中原谁当皇帝，马殷都向他们称臣纳贡。马殷又派人去邵州，催促张佶、李琼等人尽快平定邵州。
此时邵州城内的蒋勋已经难以支撑下去。被围困数月，城中士气低迷，同时缺衣少粮。蒋勋在得知刘建锋已死，马殷继任节度使之后，生出了一线希望。他知道马殷为人宽厚，何况自己是马殷的爱妻文香长辈，当年有恩于文香。蒋勋便派人出城向马殷求和，但是他答应归附马殷，却依然要求任命他为邵州刺史。